Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CUL3Q13618 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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CUL3Q13618 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CUL3Q13618 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CUL3Q13618 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CUL3Q13618 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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CUL3Q13618 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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