Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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MTMR3Q13615 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MTMR3Q13615 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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