Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PKD2Q13563 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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