Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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