Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE3BQ13370 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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