Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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PTGDRQ13258 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTGDRQ13258 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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