Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME3Q13232 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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