Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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