Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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