Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms