Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SYCNQ0VAF6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms