Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSC1Q08554 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms