Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FMODQ06828 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FMODQ06828 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms