Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CALD1Q05682 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms