Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPN12Q05209 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms