Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE3AQ05086 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms