Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CAV1Q03135 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms