Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC073911.2-201ENST00000624989 468 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-242ENST00000627496 807 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC080079.1-201ENST00000509326 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NTF3-201ENST00000331010 1028 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNB1Q02641 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms