Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NHLH2Q02577 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms