Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IRF8Q02556 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IRF8Q02556 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms