Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms