Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPIBQ01892 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms