Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BEX3Q00994 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms