Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CDK16Q00536 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms