Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GTF2BQ00403 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms