Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MPP1Q00013 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms