Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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FAM3AP98173 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
FAM3AP98173 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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