Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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