Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HERVK_113P63132 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms