Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
RPS29P62273 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
RPS29P62273 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms