Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms