Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms