Protein–RNA interactions for Protein: P58743

SLC26A5, Prestin, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A5P58743 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC26A5P58743 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC26A5P58743 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms