Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB28P51157 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB28P51157 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms