Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TAF6P49848 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms