Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS4P49798 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS4P49798 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms