Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GDF5P43026 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GDF5P43026 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GDF5P43026 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GDF5P43026 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms