Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGM1P36871 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PGM1P36871 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PGM1P36871 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms