Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJC1P36383 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJC1P36383 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms