Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RYKP34925 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RYKP34925 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RYKP34925 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms