Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLR2AP24928 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms