Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

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Length 2,201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TNCP24821 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TNCP24821 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TNCP24821 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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