Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TCP1P17987 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TCP1P17987 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TCP1P17987 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TCP1P17987 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TCP1P17987 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TCP1P17987 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms