Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-EP13747 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-EP13747 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms