Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD8P13378 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms