Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BMP4P12644 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
BMP4P12644 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BMP4P12644 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BMP4P12644 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms