Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHRNB1P11230 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms