Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLBP06746 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLBP06746 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLBP06746 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms