Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRT6BP04259 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms