Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG7O95352 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATG7O95352 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATG7O95352 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG7O95352 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms